Fakultas agama islam adalah salah satu fakultas dilingkungan unisda lamongan yang menyelenggarakan program strata satu (S1) dengan program studi pendidikan agama islam (PAI). FAI UNISDA mengalami perkembangan yang cukup pesat dengan dukungan fasilitas perkuliahan yang memadai, meliputi: ruang kuliah lantai tiga, perpustakaan, laboratorium bahasa, laboratoriumkomputer, dan internet.
FAI UNISDA merupakan fakultas agama terdepan dalam kualitas tanaga pengajar yang terdiri dari dosen professional dan berkualifikasi S2 dan S3. dengan 14 magister agama menjadikan FAI UNISDA mampu menghasilkan lulusan yan setara dengan perguruan tinggi negeri. Diantara tanaga pengajar FAI, adalah lulusan perguruan tinggi luar negeri, diantaranya: Al- Azhar Mesir, international islamic university islamabat Pakistan, dan umul Qura Makkah.
Dalam mengembangkan wawasan intelektual mahasiswa, FAI menjalin kerjasama dengan beberapa universitas terkemuka. Disamping itu FAI mempunyai guru besar diantaranya Prof. Dr. Said Aqil Siraj, M.A., Prof. Dr. H. Ahmad Shodiqi, S.H., dan Prof. Dr. Alwy Shihab.
FAI membekali mahasiswa dengan keunggulan kompetitif yakni keahlian dalam bidang perencanaan pendidikan dan pengajaran (Agama Islam, Bahasa Arab, Guru MI dan RA) dan Ekonomi syari’ah.