Fakultas Agama Islam (FAI) adalah salah satu fakultas dilingkungan UNISDA Lamongan yang menyelenggarakan program studi agama islam. FAI UNISDA merupakan fakultas agama terdepan dalam kualitas tanaga pengajar yang terdiri dari dosen professional dan berkualifikasi S3 Doktor, serta Profesor sehingga mampu menghasilkan lulusan yang Berbudaya, Islami dan Bertaraf Internasional. Dalam mengembangkan wawasan intelektual mahasiswa, FAI menjalin kerjasama dengan beberapa universitas terkemuka. Disamping itu FAI mempunyai guru besar diantaranya Prof. Dr. Said Aqil Siraj, M.A., Prof. Dr. H. Ahmad Shodiqi, S.H., dan Prof. Dr. Alwy Shihab. FAI membekali mahasiswa dengan keunggulan kompetitif yakni keahlian dalam bidang perencanaan pendidikan dan pengajaran.